Что такое COVID19/SARS-CoV-2

Остальная часть состоит из interspersed open reading frames, которые кодируют добавочные и неструктурные белки, которые не являются существенными для репликации, но имеют иммуносупрессорную активность. [231]

Значение структурных составляющих вируса:

ORF1a – вирусная транскрипция/репликация;

ORF1b – вирусная транскрипция/репликация, рибосомальный сдвиг;

S – прикрепление к клетке и слияние с ней;

E – сборка вириона и морфогенез;

ORF7a – активирует выброс провоспалительных цитокинов для вирусного патогенеза;

N – сборка вирусного генома, транскрипция, сборка вириона.

Цикл репликации вируса в клетках дыхательных путей: прикрепление вируса к клетке хозяина и проникновение путем слияния с мембраной или эндоцитозом ? освобождение вирусного генома ? трансляция вирусного полимеразного протеина (рр1а и рр1b) ? репликация РНК ? субгеномная транскрипция ? трансляция вирусных структурных протеинов ? протеины S, E и М связываются с нуклеокапсидом ? образование зрелого вириона ? экзоцитоз.

Комплекс репликации вирусной РНК состоит из неструктурных белков:

– nsp12 (RdRp)

– nsp7

– nsp8 (I/II).

Популяционный генетический анализ 103 геномов SARS-CoV-2 показал, что в начале 2020 г. вирус эволюционировал в два основных типа (L и S). Тип L (?70%) был более распространен, чем тип S (?30%). Тип S эволюционно старше и менее агрессивен. [9] В сентябре 2021 года штаммов уже намного больше.

Gis aid.

Генетически, SARS-CoV-2 примерно на 79% похож с SARS-CoV и примерно на 50% с MERS-CoV. Zhang et al, 2020, Kirtipal et al, 2020.

Другие коронавирусы, патогенные для человека: SARS-CoV, MERS-CoV, HCoV-HKU1, HCoV-NL63, HCoV-OC43 и HCoV-229E.

Штаммы SARS-CoV-2

Эволюция вируса была ожидаемой, и чем больше распространяется SARS-CoV-2, тем больше у него возможностей для развития и мутаций. Снижение передачи с помощью установленных и проверенных методов борьбы с болезнью, а также недопущение интродукции в популяции животных являются ключевыми аспектами глобальной стратегии по сокращению появления мутаций, которые имеют негативные последствия для общественного здравоохранения.

На Gis aid доступны данные 3960 геномов SARS-CoV-2. Сент. 2021 [228]

Так, замещение D614G в феврале 2021 года увеличивает инфекционность вируса (Plante et al, 2020).